Основными задачами Высшего совета являются: обсуждение важнейших социально-экономических вопросов и имеющих особое государственное значение проблем, касающихся взаимоотношений органов исполнительной власти и органов местного самоуправления; вопросов соблюдения органами государственной власти и местного самоуправления законодательства Российской Федерации и Московской области; содействие губернатору Московской области при использовании им согласительных процедур для разрешения разногласий между органами государственной власти субъектов Российской Федерации и органами местного самоуправления муниципальных образований Московской области и другие.
Председателем Высшего совета является губернатор Московской области, членами - высшие должностные лица муниципальных образований: главы 36-ти муниципальных районов и 36-ти городских округов.
Для решения оперативных вопросов формируется президиум Высшего совета в составе восьми человек, персональный состав которого определяется губернатором Московской области и подлежит ротации один раз в полгода.
На сегодняшний день в его состав включены главы муниципальных районов: Дмитровского - Гаврилов Валерий Васильевич, Мытищинского - Азаров Виктор Сергеевич, Рузского - Якунин Олег Александрович, Ступинского - Челпан Павел Иванович, городских округов: Дубна - Прох Валерий Эдуардович, Коломна - Шувалов Валерий Иванович, Подольск - Пестов Николай Игоревич и Реутов - Ходырев Александр Николаевич.
Обязанности секретаря Высшего совета возложены на советника губернатора Московской области Демешкана Владимира Семёновича.
